EGCM-PD 启动子设计

序列到设计图谱
-1000-500TSS
TATA
核心启动子
W-box
WRKY 相关
G-box
bHLH/bZIP
AGTTGAC
根模块候选
序列分析
识别常见 motif,给出位置、GC 含量和潜在上游 TF 家族。
定向编辑
根据根、胚乳等目标模块推荐替换、插入或保留位点。
候选生成
不输入序列时,按组织目标返回至少 5 条优先验证序列。

选择任务并运行分析

先选择分析、编辑或候选生成。结果会显示 motif 命中、上游 TF 家族线索、推荐编辑位点和可复制的候选序列。

序列信号
motif、TF 线索与编辑建议。
TATACAATG-boxW-box根模块
根特异表达
胚乳负向筛选
精细胚乳模块
精细胚模块
当前任务

分析我的启动子序列

平台简介

植物启动子分析与设计

平台提供启动子编辑候选、组织模块筛选、验证序列查看和目标导向的设计流程,适合在实验前进行方案比较和优先级判断。

平台能力

从生物学目标到候选序列

1. 数据统一统一基因编号、组织标签和基因组版本
2. 证据筛选保留证据支持度较高的组织模块
3. 保守编辑围绕目标 motif 给出可解释的编辑方案
4. 风险过滤评估非目标组织和序列背景影响
5. 实验评估支持原生与编辑启动子的报告基因对照

模型流程图

候选生成与实验评估流程

EGCM-PD 系统流程图
从表达证据、基因组注释和启动子序列特征进入候选筛选。
EGCM-PD 候选筛选与验证流程图
展示候选筛选、优先级分布、物种覆盖和验证策略。

目标筛选

按目标组织筛选候选

选择目标组织、物种和优先级后,系统会聚合推荐候选,便于快速进入候选比较和序列查看。

支持模块

当前可用于设计的组织模块

查看暂未启用的组织背景

候选浏览

启动子编辑候选 0

验证序列

用于实验评估的启动子序列

选择一条验证序列查看完整序列

未选择序列